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銀的抗菌機理實際上就是一個物理化學反應的程序：
奈米銀之所以能殺菌而不傷害益菌和正常細胞，因細菌有兩種，一是害菌，二是益菌，99%以上的害菌都是單層細胞體，所有的益菌都是多層細胞體，研究表明銀只對單層細胞細菌產生效力，而對多層細胞體的細菌是起不到作用的，也就是說奈米銀只殺害菌而不殺益菌 ，層細胞體的害菌，牠們的呼吸必須依靠氧代謝酶的氧化作用來完成，而氧代謝酶的氧化作用就是從中性粒子中奪取一個電子的程序。
目前所謂銀的殺菌機制，重點在於當奈米銀靠近病毒、真菌類、細菌或者嗜菌體時，將使其對氧產生代謝的蛋白酵素產生裂解，失去效能後，他們對氧無法產生正常代謝作用，導致其自然死亡，而驅體則隨人體新陳代謝排出體外。這點和我們所購買殺菌藥物不同，他會將身體內的好菌也一併殺死。奈米銀離開身體後，則細胞仍原封不動的保存著，所以奈米銀對人體、爬蟲類、植物等多細胞生物是安全的。
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